غربالگری لاین‌های آلوپلاسمیک برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD

Authors

  • اولادی, مرتضی
  • علوی, سید محمد
  • نعمت زاده, قربانعلی
  • هاشمی, سیدحمیدرضا
Abstract:

In three-line system, cytoplasmic male sterile (CMS) lines often were contaminated with cognate iso-nuclear maintainer lines during seeds multiplication processes. Therefore fingerprinting of breeding lines and identification of line-specific markers are prerequisite in genetic purity test. Six CMS lines including Neda-A, Nemat-A, Dasht-A, Amol 3-A, Champa-A, IR58025A and their iso-nuclear maintainers were used in this study. Twenty-five random amplified polymorphic DNA (RAPD) primers used for screening CMS lines and maintainer lines. The result indicated that the iso-gene lines had similar band patterns in most marker loci due to similar genetic background that present between CMS lines and co-maintainer lines. However two specific bands, 950 bp and 850 bp were produced by OPH20 and OPH01 primers that could uniquely recognize the CMS lines from their cognate maintainer lines, respectively. The genetic nature of OPH20-950 band was determinated by isolation of fragment from gel, clone to Escherichia coli bacteria via T/A cloning system, and was sequenced. A BLAST search of OPH20-950 sequence with GenBank indicated 95% homology to a rice mitochondrial DNA. These line-specific fragments could be used as a specific feature (scare marker) for characterization and genetic purity test of WA CMS lines.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

غربالگری لاین های آلوپلاسمیک برنج (oryza sativa l.) با استفاده از نشانگر مولکولی rapd

در سیستم سه لاینی تولید بذر هیبرید برنج، بخش اعظمی از ناخالصی ژنتیکی در مرحله تکثیر و نگهداری لاین های نر عقیم سیتوپلاسمی (cms) صورت می گیرد، در نتیجه بذور لاین های cms با بذور لاین های نگهدارنده (b) اختلاط می یابند. در این راستا انگشت نگاری لاین های اصلاحی و شناسایی نشانگرهای اختصاصی، پیش زمینه آزمون خلوص ژنتیکی این لاین ها است. بدین منظور شش لاین نر عقیم سیتوپلاسمی شامل ندا a، نعمت a، دشت a، ...

full text

Genetic polymorphism in rice (Oryza sativa L.) through RAPD analysis

Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) assay was performed to estimate genetic polymorphism in six different rice (Oryza sativa L.) cultivars viz. Basmati 370, DM 25, IRATOM 24, Binadhan 6, TNDB 100 and Y 1281. Three out of the 15 decamer random primers showed amplification of genomic DNA in 24 individuals. The primers produced a total of 26 bands of which 14 were polymorphic. Proportion of po...

full text

نقشه‌یابی ژن آنتوسیانین ساقه برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره

full text

غربالگری ژنوتیپ‌های برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از شاخص‌های تحمل و روش‌های چند متغیره در شرایط تنش خشکی

به­منظور شناسایی ژنوتیپ­های برنج متحمل به تنش خشکی، آزمایشی گلدانی روی 40 ژنوتیپ برنج بومی و اصلاح شده در شرایط بدون تنش و تنش آب (قطع آب در مرحله آبستنی) به­صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار در سال 1393 در موسسه تحقیقات برنج کشور اجرا شد. براساس شاخص­های رایج تحمل تنش (TOL، SSI، STI، MP، GMP و HM)، 17 ژنوتیپ انتخاب و در سال دوم (1394) در دو محیط در مزرعه؛ بدون تنش (آبیاری کام...

full text

ارزیابی تنوع مولکولی ژنوتیپ‌های برنج (Oryza sativa L.) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره همبسته با خصوصیات زراعی و فیزیکوشیمیایی دانه

به منظور ارزیابی تنوع مولکولی و طبقه‌بندی ژنوتیپ‌های برنج، تعداد 94 ژنوتیپ برنج موجود در کلکسیون موسسه تحقیقات برنج کشور مورد ارزیابی قرار گرفتند. در این آزمایش از52 جفت آغازگر ریزماهواره‌ پیوسته با ژن‌های کنترل‌کننده خصوصیات مهم زراعی و فیزیکوشیمیائی دانه برنج با توزیع نسبتا یکنواخت روی 12 جفت کروموزوم برنج استفاده شد. در این آزمایش، تعداد آلل‌های چندشکل 361 آلل با متوسط 750/4 آلل در هر مکان ژ...

full text

نقشه یابی ژن آنتوسیانین ساقه برنج (oryza sativa l.) با استفاده از نشانگرهای مولکولی ریزماهواره

وجود رنگدانه­های آنتوسیانین در برنج و سایر گیاهان عامل اصلی تولید ساقه ارغوانی رنگ محسوب می­شود. درک درست از مسیر بیوسنتزی آنتوسیانین باعث توسعه­ ابزار قدرتمندی در زمینه­ بیولوژی مولکولی و ژنتیک برنج می­شود. برای مطالعه الگوی تفرق ژن آنتوسیانین ساقه تعداد 123 تک بوته از جمعیت f2 حاصل از تلاقی 18-33 - dn / ندا a ، مورد مطالعه قرار گرفت. تک ­ بوته ­ های f2 بر اساس رنگ ساقه مورد ارزیابی و طبقه ­ ب...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 1  issue 2

pages  43- 54

publication date 2009-05

{@ msg @}

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023